＜現金 ×××円／ 売掛金 ×××円＞
小切手は、原則「現金」で処理します。
現金との区別が紛らわしいのであれば、現金の補助科目に「小切手」を設定してはどうでしょうか。
預金口座へ入金になったときに、
＜○○預金 ×××円／ 現金 ×××円＞
となります。
ただし、小切手を即日当座預金へ入金するのであれば、「現金」を通過させるのを省略して
＜当座預金 ×××円／ 売掛金 ×××円＞
としてもよいと思います。
＜○○預金 ×××円 ／ 売掛金 ×××円＞
＜支払手数料 ×××円 ＞
控除された振込手数料は、「支払手数料」（又は「雑費」）で処理します。
＜○○預金 ×××円 ／ 売掛金 ×××円＞
＜支払手数料 ×××円 ＞
カード手数料は、消費税法上は債権譲渡費用となりますので、消費税は非課税です。
通常の売掛金とカード会社分を分けるために、貸方科目は、「未収入金」を使用してもよいと思います。